На протяжении действия системы электронного администрирования НДС (далее — СЭА) в тестовом режиме (до 1 июля 2015 года или до даты, определенной в отдельном решении ВРУ о сокращении срока переходного периода) плательщики НДС самостоятельно зачисляют на электронные счета средства с собственных текущих счетов, в суммах, необходимых для уплаты в бюджет согласованных налоговых обязательств по этому налогу, задекларированных ими в отчетности по НДС.
По истечении тестового режима для регистрации налоговых накладных в ЕРНН плательщик НДС должен иметь достаточную сумму налогового кредита, подтвержденную зарегистрированными в ЕРНН «входными» налоговыми накладными, уплатой НДС при импорте товаров и (при недостаточности таких сумм) средствами на его счете в СЭА.